Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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