Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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ITGB3BPQ13352 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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ITGB3BPQ13352 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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