Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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