Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 LITAF-221ENST00000622633 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 LHX6-204ENST00000394319 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 NMRAL2P-204ENST00000423298 1792 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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