Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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RPA4Q13156 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RPA4Q13156 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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RPA4Q13156 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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RPA4Q13156 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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