Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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DUSP4Q13115 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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DUSP4Q13115 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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DUSP4Q13115 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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DUSP4Q13115 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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DUSP4Q13115 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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DUSP4Q13115 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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DUSP4Q13115 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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DUSP4Q13115 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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