Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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