Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms