Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms