Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

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Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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TFF3Q07654 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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TFF3Q07654 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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TFF3Q07654 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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TFF3Q07654 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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TFF3Q07654 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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TFF3Q07654 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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TFF3Q07654 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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TFF3Q07654 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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TFF3Q07654 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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