Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms