Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EMX2Q04743 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms