Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms