Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AIF1P55008 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AIF1P55008 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AIF1P55008 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AIF1P55008 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AIF1P55008 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AIF1P55008 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AIF1P55008 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AIF1P55008 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AIF1P55008 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AIF1P55008 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AIF1P55008 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AIF1P55008 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AIF1P55008 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AIF1P55008 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AIF1P55008 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AIF1P55008 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AIF1P55008 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AIF1P55008 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AIF1P55008 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AIF1P55008 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AIF1P55008 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AIF1P55008 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AIF1P55008 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AIF1P55008 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AIF1P55008 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AIF1P55008 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AIF1P55008 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AIF1P55008 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AIF1P55008 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AIF1P55008 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AIF1P55008 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AIF1P55008 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AIF1P55008 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AIF1P55008 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AIF1P55008 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AIF1P55008 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AIF1P55008 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AIF1P55008 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AIF1P55008 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AIF1P55008 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AIF1P55008 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AIF1P55008 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
AIF1P55008 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AIF1P55008 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
AIF1P55008 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AIF1P55008 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AIF1P55008 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AIF1P55008 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AIF1P55008 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AIF1P55008 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AIF1P55008 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AIF1P55008 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AIF1P55008 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AIF1P55008 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms