Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.9 ms