Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX1P48742 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX1P48742 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX1P48742 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX1P48742 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX1P48742 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX1P48742 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX1P48742 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX1P48742 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX1P48742 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX1P48742 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX1P48742 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX1P48742 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX1P48742 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX1P48742 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX1P48742 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX1P48742 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX1P48742 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX1P48742 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX1P48742 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX1P48742 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms