Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLCP48506 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLCP48506 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLCP48506 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLCP48506 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLCP48506 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLCP48506 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLCP48506 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLCP48506 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLCP48506 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLCP48506 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLCP48506 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLCP48506 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLCP48506 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLCP48506 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLCP48506 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLCP48506 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLCP48506 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLCP48506 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLCP48506 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLCP48506 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLCP48506 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLCP48506 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLCP48506 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLCP48506 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLCP48506 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLCP48506 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms