Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms