Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms