Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms