Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms