Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCKARP32238 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCKARP32238 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.1 ms