Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTSSP25774 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTSSP25774 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTSSP25774 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTSSP25774 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTSSP25774 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTSSP25774 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTSSP25774 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTSSP25774 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTSSP25774 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTSSP25774 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CTSSP25774 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTSSP25774 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTSSP25774 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTSSP25774 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTSSP25774 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTSSP25774 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTSSP25774 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTSSP25774 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTSSP25774 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTSSP25774 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTSSP25774 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTSSP25774 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTSSP25774 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTSSP25774 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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CTSSP25774 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CTSSP25774 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTSSP25774 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTSSP25774 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTSSP25774 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTSSP25774 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTSSP25774 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTSSP25774 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTSSP25774 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTSSP25774 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTSSP25774 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTSSP25774 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTSSP25774 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTSSP25774 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTSSP25774 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTSSP25774 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTSSP25774 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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CTSSP25774 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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CTSSP25774 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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CTSSP25774 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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CTSSP25774 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTSSP25774 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTSSP25774 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTSSP25774 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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CTSSP25774 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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CTSSP25774 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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CTSSP25774 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CTSSP25774 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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CTSSP25774 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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