Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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