Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms