Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms