Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DESP17661 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DESP17661 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DESP17661 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DESP17661 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DESP17661 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DESP17661 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DESP17661 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DESP17661 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DESP17661 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DESP17661 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DESP17661 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DESP17661 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DESP17661 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DESP17661 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DESP17661 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DESP17661 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DESP17661 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DESP17661 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DESP17661 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DESP17661 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DESP17661 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DESP17661 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DESP17661 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DESP17661 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DESP17661 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DESP17661 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DESP17661 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DESP17661 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DESP17661 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DESP17661 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DESP17661 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DESP17661 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DESP17661 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DESP17661 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DESP17661 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DESP17661 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DESP17661 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DESP17661 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DESP17661 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DESP17661 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DESP17661 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DESP17661 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DESP17661 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DESP17661 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DESP17661 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DESP17661 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DESP17661 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DESP17661 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DESP17661 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DESP17661 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DESP17661 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DESP17661 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DESP17661 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DESP17661 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms