Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAV1P15498 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms