Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHOP08100 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHOP08100 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHOP08100 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHOP08100 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHOP08100 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHOP08100 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHOP08100 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHOP08100 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHOP08100 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms