Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F9P00740 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F9P00740 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F9P00740 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F9P00740 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F9P00740 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F9P00740 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F9P00740 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F9P00740 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F9P00740 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F9P00740 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F9P00740 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F9P00740 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F9P00740 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F9P00740 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
F9P00740 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
F9P00740 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
F9P00740 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
F9P00740 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
F9P00740 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
F9P00740 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
F9P00740 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
F9P00740 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
F9P00740 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
F9P00740 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
F9P00740 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
F9P00740 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
F9P00740 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
F9P00740 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
F9P00740 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
F9P00740 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
F9P00740 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
F9P00740 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
F9P00740 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
F9P00740 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
F9P00740 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
F9P00740 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
F9P00740 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
F9P00740 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
F9P00740 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
F9P00740 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
F9P00740 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
F9P00740 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
F9P00740 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
F9P00740 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
F9P00740 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
F9P00740 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
F9P00740 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
F9P00740 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
F9P00740 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
F9P00740 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
F9P00740 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
F9P00740 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
F9P00740 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms