Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SIX3O95343 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX3O95343 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX3O95343 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX3O95343 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX3O95343 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SIX3O95343 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX3O95343 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX3O95343 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX3O95343 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX3O95343 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX3O95343 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX3O95343 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX3O95343 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX3O95343 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX3O95343 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX3O95343 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX3O95343 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX3O95343 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX3O95343 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SIX3O95343 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX3O95343 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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SIX3O95343 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX3O95343 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SIX3O95343 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX3O95343 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX3O95343 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX3O95343 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX3O95343 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX3O95343 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX3O95343 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX3O95343 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX3O95343 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX3O95343 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SIX3O95343 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SIX3O95343 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX3O95343 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SIX3O95343 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX3O95343 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX3O95343 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SIX3O95343 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX3O95343 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX3O95343 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX3O95343 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX3O95343 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX3O95343 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX3O95343 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX3O95343 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX3O95343 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX3O95343 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX3O95343 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX3O95343 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX3O95343 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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