Protein–RNA interactions for Protein: O94876

TMCC1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC1O94876 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC1O94876 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms