Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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MSI1O43347 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSI1O43347 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSI1O43347 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSI1O43347 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSI1O43347 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSI1O43347 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSI1O43347 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSI1O43347 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MSI1O43347 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSI1O43347 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSI1O43347 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSI1O43347 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSI1O43347 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSI1O43347 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MSI1O43347 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSI1O43347 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MSI1O43347 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSI1O43347 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSI1O43347 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSI1O43347 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSI1O43347 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSI1O43347 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSI1O43347 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSI1O43347 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSI1O43347 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSI1O43347 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSI1O43347 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MSI1O43347 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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MSI1O43347 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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MSI1O43347 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSI1O43347 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSI1O43347 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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MSI1O43347 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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MSI1O43347 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSI1O43347 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSI1O43347 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSI1O43347 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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MSI1O43347 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSI1O43347 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSI1O43347 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSI1O43347 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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MSI1O43347 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSI1O43347 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSI1O43347 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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MSI1O43347 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSI1O43347 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSI1O43347 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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MSI1O43347 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSI1O43347 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSI1O43347 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSI1O43347 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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MSI1O43347 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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MSI1O43347 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSI1O43347 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSI1O43347 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSI1O43347 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSI1O43347 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSI1O43347 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSI1O43347 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSI1O43347 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MSI1O43347 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSI1O43347 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSI1O43347 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSI1O43347 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSI1O43347 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSI1O43347 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSI1O43347 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSI1O43347 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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