Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCAO15360 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCAO15360 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCAO15360 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCAO15360 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCAO15360 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCAO15360 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCAO15360 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCAO15360 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCAO15360 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCAO15360 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCAO15360 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCAO15360 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCAO15360 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCAO15360 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCAO15360 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCAO15360 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCAO15360 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCAO15360 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCAO15360 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCAO15360 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCAO15360 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCAO15360 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCAO15360 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCAO15360 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCAO15360 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCAO15360 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCAO15360 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCAO15360 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCAO15360 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCAO15360 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCAO15360 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCAO15360 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCAO15360 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCAO15360 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCAO15360 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCAO15360 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCAO15360 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCAO15360 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCAO15360 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCAO15360 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCAO15360 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCAO15360 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCAO15360 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCAO15360 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCAO15360 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCAO15360 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCAO15360 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCAO15360 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCAO15360 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCAO15360 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCAO15360 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCAO15360 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCAO15360 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCAO15360 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCAO15360 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCAO15360 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCAO15360 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCAO15360 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCAO15360 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCAO15360 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCAO15360 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCAO15360 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCAO15360 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCAO15360 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCAO15360 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCAO15360 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCAO15360 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCAO15360 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCAO15360 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCAO15360 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCAO15360 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FANCAO15360 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FANCAO15360 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FANCAO15360 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FANCAO15360 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FANCAO15360 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FANCAO15360 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FANCAO15360 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FANCAO15360 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FANCAO15360 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
FANCAO15360 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
FANCAO15360 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FANCAO15360 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FANCAO15360 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FANCAO15360 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
FANCAO15360 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FANCAO15360 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FANCAO15360 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FANCAO15360 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FANCAO15360 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
FANCAO15360 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FANCAO15360 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FANCAO15360 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCAO15360 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCAO15360 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCAO15360 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCAO15360 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCAO15360 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCAO15360 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms