Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP17L12C9JPN9 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms