Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms