Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms