Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGTPBP1Q9UPW5 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms