Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 Metazoa_SRP.91-201ENST00000622745 281 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms