Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms