Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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COPS7AQ9UBW8 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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COPS7AQ9UBW8 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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COPS7AQ9UBW8 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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COPS7AQ9UBW8 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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COPS7AQ9UBW8 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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COPS7AQ9UBW8 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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COPS7AQ9UBW8 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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