Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms