Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD1BQ9P298 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms