Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms