Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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CNTN3Q9P232 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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CNTN3Q9P232 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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CNTN3Q9P232 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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CNTN3Q9P232 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CNTN3Q9P232 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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CNTN3Q9P232 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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