Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms