Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms