Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms