Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms