Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 DENND4C-205ENST00000434457 6718 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 ANKRD26-202ENST00000436985 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms